PPAR(全稱為“過氧化物酶體增殖物激活受體”)信號通路包括多個蛋白質，其中最重要的蛋白質是PPAR本身，其它關鍵蛋白包括：
RXR(維甲酸X受體)：PAPR必須與RXR配對才能形成活性異二聚體。
PGC-1α(PPARγ共激活因子1α)：PPARγ的輔助蛋白，參與調控線粒體代謝等生物學過程。
NCoR(核受體共抑制因子)、SMRT(靶基因共抑制因子)：分別為轉錄抑制因子核受體共抑制蛋白和靶基因共抑制蛋白。它們與PPAR共同作用來抑制某些基因的表達。
SRC-1(轉錄激活蛋白-1)：促進PPAR的轉錄活性。
SIRT1(去乙?；?)：與PPAR共同參與調節線粒體代謝和細胞代謝途徑等生物學過程。
這些蛋白相互作用，共同調節PPAR信號通路在生物體中的功能執行。